জগন্নাথপুর সিলেট বিভাগের সুনামগঞ্জ জেলার অন্তর্গত একটি উপজেলা। বাংলাদেশে উপজেলা ব্যবস্থা প্রবর্তনের পর ১৯৮৩ সালের ২৯ সেপ্টেম্বর এই জগন্নাথপুর থানাকে উপজেলায় উত্তীর্ণ করা হয়।
নবীনতর পূর্বতন